Multiple Sclerosis Discovery Forum
  News and Future Directions
  Papers
  Forums
  Professional Resources
  Research Resources
MSGene - Polymorphism Details
Back Search Methods Disclaimer Credits
 Study: IMSGC, 2008
 Gene: IL2RA  (RP11-536K7.1; CD25; IDDM10; IL2R; TCGFR)  Entrez Gene    View on PDGene
 Protein: interleukin 2 receptor, alpha  (Interleukin-2 receptor; interleukin 2 receptor, alpha chain)  ProteinLink
 Chromosome: 10   (View: 1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11  12  13  14  15  16  17  18  19  20  21  22  X  Y  MT)
 Status: Updated 25 November 2011
Meta-Analysis     Gene Overview
Total number of polymorphisms investigated by this study: 3

Case-Control Studies (by ethnic group)
  Genotypes
Polymorphism ID#
(Link to NCBI)
Population   G-Allele A-Allele G/G
(frequency)
G/A
(frequency)
A/A
(frequency)
 Caucasian
rs2104286i Overlaps with Hoppenbrouwers, 2009 (Netherlands) MS
CTR
-
-
-
-
0 (-)
0 (-)
0 (-)
0 (-)
0 (-)
0 (-)
(-) :  Either no data provided, or data otherwise not eligible for inclusion (see methods for details).

Case-Control Studies (by ethnic group)
  Genotypes
Polymorphism ID#
(Link to NCBI)
Population   G-Allele A-Allele G/G
(frequency)
G/A
(frequency)
A/A
(frequency)
 Caucasian
rs2104286 Australia MS
CTR
0.22
0.29
0.78
0.71
23 (0.049)
36 (0.085)
161 (0.341)
174 (0.410)
288 (0.610)
214 (0.505)
rs2104286 Belgium MS
CTR
0.19
0.22
0.81
0.78
15 (0.037)
23 (0.050)
125 (0.309)
159 (0.344)
265 (0.654)
280 (0.606)
rs2104286 Denmark MS
CTR
-
-
-
-
0 (-)
0 (-)
0 (-)
0 (-)
0 (-)
0 (-)
rs2104286 Finland MS
CTR
0.18
0.22
0.82
0.78
19 (0.034)
51 (0.050)
168 (0.299)
352 (0.346)
374 (0.667)
614 (0.604)
rs2104286 Germany MS
CTR
0.20
0.25
0.80
0.75
8 (0.039)
37 (0.061)
66 (0.320)
226 (0.374)
132 (0.641)
342 (0.565)
rs2104286 UK (Northern Ireland) MS
CTR
0.25
0.30
0.75
0.70
41 (0.060)
49 (0.092)
253 (0.370)
225 (0.423)
389 (0.570)
258 (0.485)
rs2104286 Italy MS
CTR
0.19
0.20
0.81
0.80
32 (0.037)
32 (0.041)
268 (0.311)
250 (0.323)
563 (0.652)
493 (0.636)
rs2104286 Norway MS
CTR
0.25
0.30
0.75
0.70
45 (0.061)
95 (0.093)
276 (0.374)
435 (0.424)
417 (0.565)
497 (0.484)
rs2104286 Spain MS
CTR
0.19
0.23
0.81
0.77
28 (0.034)
40 (0.051)
247 (0.303)
275 (0.350)
540 (0.663)
471 (0.599)
rs2104286 Sweden MS
CTR
0.25
0.28
0.75
0.72
70 (0.064)
95 (0.076)
415 (0.377)
500 (0.400)
615 (0.559)
656 (0.524)
rs2104286 UK MS
CTR
0.25
0.28
0.75
0.72
141 (0.061)
239 (0.081)
861 (0.371)
1204 (0.407)
1321 (0.569)
1517 (0.513)
rs2104286 USA MS
CTR
0.22
0.25
0.78
0.75
66 (0.047)
158 (0.064)
474 (0.340)
932 (0.378)
855 (0.613)
1376 (0.558)
rs2104286 Overlaps with Sanna, 2010 MS
CTR
-
-
-
-
0 (-)
0 (-)
0 (-)
0 (-)
0 (-)
0 (-)


Case-Control Studies (by ethnic group)
  Genotypes
Polymorphism ID#
(Link to NCBI)
Population   A-Allele G-Allele A/A
(frequency)
A/G
(frequency)
G/G
(frequency)
 Caucasian
rs12722489 Overlaps with Sanna, 2010 MS
CTR
0.07
0.10
0.93
0.90
4 (0.004)
6 (0.010)
117 (0.129)
102 (0.177)
788 (0.867)
468 (0.813)
rs12722489 Australia MS
CTR
0.11
0.15
0.89
0.85
6 (0.013)
10 (0.024)
95 (0.201)
108 (0.255)
371 (0.786)
306 (0.722)
rs12722489 Belgium MS
CTR
0.10
0.13
0.90
0.87
4 (0.010)
7 (0.015)
74 (0.183)
102 (0.221)
327 (0.807)
353 (0.764)
rs12722489 Denmark MS
CTR
0.15
0.20
0.85
0.80
11 (0.022)
21 (0.039)
127 (0.252)
173 (0.320)
366 (0.726)
347 (0.641)
rs12722489 Finland MS
CTR
0.13
0.13
0.87
0.87
9 (0.016)
18 (0.018)
123 (0.219)
235 (0.231)
429 (0.765)
764 (0.751)
rs12722489 Germany MS
CTR
0.11
0.15
0.89
0.85
3 (0.015)
13 (0.021)
41 (0.199)
153 (0.253)
162 (0.786)
439 (0.726)
rs12722489 UK (Northern Ireland) MS
CTR
0.15
0.19
0.85
0.81
16 (0.023)
20 (0.038)
178 (0.261)
166 (0.312)
489 (0.716)
346 (0.650)
rs12722489 Italy MS
CTR
0.10
0.10
0.90
0.90
8 (0.009)
8 (0.010)
153 (0.177)
144 (0.186)
702 (0.813)
622 (0.804)
rs12722489 Overlaps with Hoppenbrouwers, 2009 (Netherlands) MS
CTR
-
-
-
-
0 (-)
0 (-)
0 (-)
0 (-)
0 (-)
0 (-)
rs12722489 Norway MS
CTR
0.17
0.22
0.83
0.78
22 (0.030)
52 (0.051)
210 (0.285)
357 (0.348)
506 (0.686)
618 (0.602)
rs12722489 Spain MS
CTR
0.20
0.21
0.80
0.79
34 (0.042)
34 (0.043)
263 (0.323)
258 (0.328)
518 (0.636)
494 (0.628)
rs12722489 Sweden MS
CTR
0.18
0.19
0.82
0.81
35 (0.032)
43 (0.034)
323 (0.294)
377 (0.301)
742 (0.675)
831 (0.664)
rs12722489 UK MS
CTR
0.13
0.17
0.87
0.83
42 (0.018)
84 (0.028)
539 (0.232)
827 (0.279)
1742 (0.750)
2049 (0.692)
rs12722489 USA MS
CTR
0.12
0.15
0.88
0.85
20 (0.014)
53 (0.021)
294 (0.211)
615 (0.249)
1080 (0.775)
1798 (0.729)


Family-Based Studies (by ethnic group)
  Genotypes
Polymorphism ID#
(Link to NCBI)
Population   G-Allele A-Allele G/G
(frequency)
G/A
(frequency)
A/A
(frequency)
 Caucasian
rs2104286 Belgium MS
CTR
-
-
-
-
0 (-)
0 (-)
0 (-)
0 (-)
0 (-)
0 (-)
rs2104286 Finland MS
CTR
-
-
-
-
0 (-)
0 (-)
0 (-)
0 (-)
0 (-)
0 (-)
rs2104286 France MS
CTR
-
-
-
-
0 (-)
0 (-)
0 (-)
0 (-)
0 (-)
0 (-)
rs2104286 UK MS
CTR
-
-
-
-
0 (-)
0 (-)
0 (-)
0 (-)
0 (-)
0 (-)
rs2104286 USA MS
CTR
-
-
-
-
0 (-)
0 (-)
0 (-)
0 (-)
0 (-)
0 (-)
rs2104286 Italy (Sardinia) MS
CTR
-
-
-
-
0 (-)
0 (-)
0 (-)
0 (-)
0 (-)
0 (-)
(-) :  Either no data provided, or data otherwise not eligible for inclusion (see methods for details).

Family-Based Studies (by ethnic group)
  Genotypes
Polymorphism ID#
(Link to NCBI)
Population   A-Allele G-Allele A/A
(frequency)
A/G
(frequency)
G/G
(frequency)
 Caucasian
rs12722489 Italy (Sardinia) MS
CTR
-
-
-
-
0 (-)
0 (-)
0 (-)
0 (-)
0 (-)
0 (-)
rs12722489 Belgium MS
CTR
-
-
-
-
0 (-)
0 (-)
0 (-)
0 (-)
0 (-)
0 (-)
rs12722489 Finland MS
CTR
-
-
-
-
0 (-)
0 (-)
0 (-)
0 (-)
0 (-)
0 (-)
rs12722489 France MS
CTR
-
-
-
-
0 (-)
0 (-)
0 (-)
0 (-)
0 (-)
0 (-)
rs12722489 UK MS
CTR
-
-
-
-
0 (-)
0 (-)
0 (-)
0 (-)
0 (-)
0 (-)
rs12722489 USA MS
CTR
-
-
-
-
0 (-)
0 (-)
0 (-)
0 (-)
0 (-)
0 (-)
(-) :  Either no data provided, or data otherwise not eligible for inclusion (see methods for details).
Print this page
Email this page
MSDF RSS

Text size
Share & Bookmark
MSGene Recent Updates
MSGene Top Results
Top Results Details
1. HLA-DRB1
2. IL2RA
3. IL7R
4. TAGAP
5. CLEC16A
6. EVI5
7. GWA_16q24.1
8. GWA_5p13.1
9. TTC34
10. AHI1   
[see more]
MSGene Stats
Studies: 789
Genes: 809
Polymorphisms: 2907
Meta-analyses: 324
ALSGene
AlzGene
MSGene
PDGene
SZGene
An up-to-date collection of all published genetic association studies.
Copyright © 2024 Biomedical Research Forum LLC Disclaimer Copyright